《海賊王》中，別看惡魔果實是強大力量的來源，一個運用不好，可是會遭到惡魔果實的反噬的，因為惡魔果實也是擁有副作用的。別的果實還好，越是強大的惡魔果實副作用越厲害。這可以說是惡魔果實的一個缺陷了。
當然，所有的惡魔果實都有一個普遍的副作用，那就是旱鴨子，不能使人游泳，一旦碰到了水，能力者就不能動彈。不過，這是大的方向，我們來說說惡魔果實的一些小方向的副作用，也是缺陷最致命的。
1.麥哲倫的毒：
推進城的麥哲倫是毒毒果實能力者，他的毒可是能夠將人溶解的，四皇級別的戰力挨到了麥哲倫的毒，也是一招倒的份。四皇戰力的黑鬍子，不就是被麥哲倫的毒一招擱倒了麼，而且還是整個四皇海賊團被麥哲倫一招毒倒了。
能打贏四皇，也證明麥哲倫擁有著四皇級別的戰力。可是麥哲倫的毒毒果實卻是有著巨大的缺陷，在毒別人的同時，也毒倒了自己，麥哲倫每天都有10個小時在拉肚子，正是因為他的毒在作祟。這一份副作用也極大的限制了麥哲倫的實力發揮，不然極有可能就是一個全新四皇戰力，畢竟麥哲倫他在毒別人的同時也在毒自己。
2.黑鬍子的雙倍傷害：
黑鬍子為了得到一顆暗暗果實，不惜潛伏於白鬍子海賊團多年，終於如願以償得到了暗暗果實，一飛沖天。可是，暗暗果實也是有著極大的副作用的，那就是受到傷害要承受著雙倍傷害，不是一般人能夠承受的。
在得到暗暗果實強大的同時，也就是得到暗暗果實的缺陷，也就是黑鬍子的體質比較強大，能承受暗暗果實所帶來的雙倍傷害。要是尋常人的話，分分鐘被暗暗果實的痛楚痛死了。
3.砂糖的長不大：
唐吉坷德家族的砂糖，是童趣果實能力者，擁有著將人變換成玩具並抹去個人存在於世間的痕跡。變成玩具的人，這就成了砂糖的軍隊，受到砂糖的操控。這種將人變成玩具的能力，連四皇都避免不了。
雖然BUG歸BUG，但是這個副作用就是限制砂糖的成長，一直保持著童年的狀態。如若不然，砂糖可就是一個20多歲的大姑娘了，卻只能一直裝扮著蘿莉的模樣。是好是壞，見仁見智吧！